基因学 CLC Genomics Workbench Premium 23.0.5 x64破解版

第23版：

本页列出了所有CLC软件产品、插件和特殊用例的要求。生物医学基因组学分析插件、CLC 单细胞分析模块、CLC 微生物基因组学模块的要求各不相同，下面单独列出，3D 分子查看器、读取映射和从头组装的特殊用例要求也是如此。请注意，使用生物医学基因组学分析分析QIAseq面板生成的数据需要16 GB RAM，建议使用24 GB。

齐根CLC基因组学工作台

^*不使用插件功能的标准要求

• 视窗 10、视窗 11、视窗服务器 2012、视窗服务器 2016、视窗服务器 2019 和视窗服务器 2022
• Mac：macOS 11、12 和 13
• Linux：RHEL 7 及更高版本、SUSE Linux Enterprise Server 12 及更高版本。该软件有望在其他最新的 Linux 系统上运行而不会出现问题，但我们不保证这一点。要使用与 BLAST 相关的功能，需要 libnsl.so.1。
• 64 位操作系统
• 建议使用 16 GB 内存（需要 8 GB 内存）
• 需要 1024 x 768 显示器
• 建议使用 1600 x 1200 显示器

用于映射读取的内存和 CPU 设置

为了映射到人类基因组（3.2千兆碱基）或类似大小的基因组，需要16 GB RAM。当映射到小基因组时，可以使用较小的系统。

在处理大型数据集时，较大的内存量有助于提高分析的整体速度，但预计超过 32 GB RAM 的增益很小。

增加 CPU 的数量可以减少读取映射所需的时间，但是，性能提升预计将限制在大约 40 个线程以上。

3D 查看器的系统要求

支持 OpenGL 2.0 的显卡。

注意：仅当 CLC 基因组学工作台安装在打开查看器的同一台计算机上时，才支持 3D 渲染。不支持间接呈现（例如通过 ssh 进行 X11 转发）、远程桌面连接/VNC 以及在虚拟机中运行。

插件和模块

生物医学基因组学分析插件

生物医学基因组学分析的系统要求与CLC基因组学工作台的系统要求相同，但以下要求除外：

• 需要 16 GB 内存
• 推荐 24 GB 内存
• tmp 目录中至少 100 GB 可用磁盘空间
• 如果未连接到 CLC 服务器并使用该服务器上的CLC_References区域，则 CLC 工作台的 CLC_References 目录中至少需要 90 GB 可用磁盘空间。CLC 工作台上的参考数据位置可以从默认位置更改，如参考数据管理器中所述。

QIAseq分析的特殊要求

以下用例具有特定的系统要求

• 对多个样本进行 UPX 3' 或 UPXome 分析有时需要超过 24 GB 的 RAM。
• 对于完整的外显子组、多模态泛癌或TMB分析，我们建议在服务器上运行（请参阅下面的要求）。内核数会显著影响运行时。

CLC光速模块

CLC LightSpeed 模块的系统要求与 CLC 基因组学工作台的系统要求相同，除了以下内容：

• 所有 光速 分析都需要 32 GB 内存。
• 需要支持 AVX2 或 NEON 指令集的 CPU。

CLC 单细胞分析模块

CLC单细胞分析模块的系统要求与CLC基因组学工作台的系统要求相同，但以下几点除外：

• 推荐 16 GB 内存

大多数工具都可以在笔记本电脑等适度的硬件上运行，尤其是当单元数低于 50,000 时。

映射读取的特殊要求

对于将读取映射到参考文献，我们建议使用 CLC 基因组学服务器（请参阅下面的要求）。虽然可以使用具有 16 GB RAM 的笔记本电脑，但当超过 1000 个单元时，大量读取可能会导致运行时间过长。

长读支持（测试版）插件

长读支持（测试版）插件的系统要求与CLC Genomics Workbench的系统要求相同，但以下几点除外：

• 工具需要支持 AVX2 或 NEON 指令集的 CPU。

CLC微生物基因组学模块

CLC微生物基因组学模块的系统要求与CLC基因组学工作台的系统要求相同，但以下几点除外：

• 使用DIAMOND和ShortBRED的工具需要支持AVX2或NEON指令集的CPU。

MLST方案工具的特殊要求

MLST方案工具的系统要求取决于MLST方案的大小（等位基因的数量和序列类型的数量）。具有16GB内存的笔记本电脑通常足以用于基于中等数量的分离株的7基因方案或cgMLST方案。键入或构造更大的方案可能需要更多内存，通常，在使用基于 100 多个隔离的 cg/wgMLST 方案时，我们建议至少使用 64GB 内存。

分类剖析器的特殊要求

分类剖析器的质量性能取决于所使用的参考数据库——数据库越完整，质量越好。但是，使用给定的数据库大小运行分类探查器至少需要相同的内存量。例如，使用 14 GB 数据库运行至少需要 16 GB RAM，使用 56 GB 数据库运行至少需要 64 GB RAM。使用下载微生物参考数据库工具创建参考数据库时，您将收到有关使用此数据库运行分类分析器所需内存要求的警告。

从头组装宏基因组的特殊要求

建议在运行从头组装宏基因组时至少具有 16 GB RAM。

其他要求

PCoA 3D 查看器要求与上述 CLC 基因组学工作台部分中描述的 3D 查看器要求相同。

Sunburst 查看器使用 JavaFX，可能无法在较旧的 Linux 内核上运行。有关 JavaFX 要求的更新列表，请访问 http://www.oracle.com/technetwork/java/javafx/downloads/supportedconfigurations-1506746.html。